普通合伙企业认定工伤的流程如下：

1. 事故报告：事故发生后企业应在之一时间内向当地劳动和社会保障部门报告工伤事故并提供事故发生的时间、地点、经过及伤者情况等详细信息。

2. 工伤认定申请：由用人单位、受伤害员工或其直系亲属向医保科或劳动和社会保障部门提出工伤认定申请，并填写《工伤认定申请表》。

3. 材料审核：劳动保障行政部门对申请人提供的材料实审核，确认是不是合工伤认定的条件。

4. 调查核实：依据需要对提供的证据实调查核实，以保障工伤认定的准确性。

5. 决定工伤认定：在受理之日起60日内劳动保障行政部门作出是否认定为工伤的决定。

6. 送达决定：工伤认定决定作出后，应在20个工作日内将决定送达申请人（受伤害员工和用人单位）。

7. 行政复议或行政诉讼：假使当事人或用人单位对工伤认定决定不服，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼。

8. 留意事项：工伤认定申请时效为1年，即事故伤害发生之日或被诊断、鉴定为职业病之日起一年内申请有效。