在州瓯海区工伤认定主要由以下地方负责：

1. 瓯海区社会保险行政部门：工伤认定申请一般需要向瓯海区社会保险行政部门提交。该部门负责接收、审核工伤认定申请，并依据相关法律法规实行工伤认定。

2. 瓯海区劳动能力鉴定委员会：在工伤职工经过治疗伤情相对稳定后若是存在残疾或作用劳动能力的情况，可向瓯海区劳动能力鉴定委员会申请劳动能力鉴定。

具体流程如下：

- 用人单位或工伤职工及其近亲属、工会组织在规定时限内，向瓯海区社会保险行政部门提出工伤认定申请。

- 社会保险行政部门对申请材料实行审核材料齐全的予以受理，不齐全的则须要补正。

- 社会保险行政部门对工伤事实实调查核实。

- 经调查核实后，社会保险行政部门在规定时间内作出工伤认定决定，并通知相关当事人。

- 如不服工伤认定结果当事人可以在规定时间内申请行政复议或提起行政诉讼。